筑波大学附属医院于1976年成立，该院共有800个床位（普通病房693床、重症病房66床、精神病房41床）该院的原发性脑肿瘤手术一年约有246台，可以说是在全日本名列前茅。此外，在日本为数不多的治疗成绩中，该院每年进行80例神经胶质瘤、50例间脑下垂体肿瘤以及50例其他的听觉神经鞘瘤等良性肿瘤的手术治疗。此外，除了在手术方面，还进行中子俘获治疗、质子治疗等特殊治疗，各种临床药物的化学疗法，肿瘤疫苗等免疫治疗的临床研究。

筑波大学于1983年正式开展质子线治疗的临床研究，在日本国内质子线治疗历史较长，治疗成绩斐然，现今为止已经进行了4000例以上的患者治疗，尤其是在全球率先开始对肝癌等发生于体内深处的癌症采用质子线治疗，其质子线治疗方法现已作为国际标准获得医学界的高度评价。目前该院正在逐步进行称为新时代粒子治疗手段的“中子俘获疗法（BNCT）”的临床研究以及其加速器的开发研究。
质子治疗中心设于筑波大学附属医院内，紧密连接内外科等各专科医师和医务人员，可以协同各科团队，为患者提供综合性的最适合的治疗方案这一大优势。即使病种相同，也必须根据每个患者的病情、年龄、体力，以及患者对治疗的想法等各个方面，进行身心结合的治疗，给患者提供最佳的治疗方案。

发展历程：
1973年  KEK（现高能加速器研究机构）提出利用大型质子加速器开展癌症粒子线治疗
1975年  EK、放射线医学研究所、筑波大学就推进粒子线项目达成合意
1976年  筑波大学成立“高LET粒子线的医学生物学利用调查”工作组，同年12月更名为“高LET放射线利用之生物化学研究委员会准备会”，在全校推进项目的开展
1977年  用大型质子加速器开始共同实验
1979年  更名为“粒子线医科中心”（限10年）
1982年  设施建成。开始用质子线进行生物实验
1983年  开始世界首台垂直射束的临床研究
1990年“粒子线医科中心”迎来10年年限，新的“质子线医学利用研究中心”启动
2001年  医院内新设施建成。废除了原中心，同名“质子线医学利用研究中心”启动
2004年  随着转为国立大学法人，“质子线医学利用中心”定位为附属医院相关中心
2008年  作为先进医疗获得国家批准
2014年“质子线治疗中心”作为诊疗科室启动

就诊时间：

周一至周五：上午9:00-12:00  下午13:00-17:00

休息日：周六，周日，节假日，年末年初